Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTXN3Q4LDR2 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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