Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC27Q2M243 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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