Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CSPP1Q1MSJ5 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms