Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FXNQ16595 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FXNQ16595 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms