Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SGCBQ16585 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SGCBQ16585 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SGCBQ16585 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
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SGCBQ16585 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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SGCBQ16585 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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SGCBQ16585 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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SGCBQ16585 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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SGCBQ16585 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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SGCBQ16585 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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