Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms