Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms