Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SYCP1Q15431 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SYCP1Q15431 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SYCP1Q15431 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SYCP1Q15431 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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