Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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