Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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