Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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