Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXO1Q12778 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXO1Q12778 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXO1Q12778 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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