Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTPS1P17812 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms