Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms