Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms