Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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