Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SP140Q13342 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SP140Q13342 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SP140Q13342 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SP140Q13342 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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