Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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SGCGQ13326 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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SGCGQ13326 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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SGCGQ13326 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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SGCGQ13326 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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