Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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SEMA3BQ13214 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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SEMA3BQ13214 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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SEMA3BQ13214 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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SEMA3BQ13214 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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