Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms