Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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FOXD4Q12950 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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FOXD4Q12950 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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FOXD4Q12950 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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FOXD4Q12950 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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FOXD4Q12950 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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