Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms