Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms