Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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