Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FXNQ16595 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms