Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms