Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms