Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SNTB1Q13884 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms