Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CDH18Q13634 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CDH18Q13634 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CDH18Q13634 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CDH18Q13634 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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