Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SP140Q13342 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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