Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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