Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PTPN13Q12923 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PTPN13Q12923 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PTPN13Q12923 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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