Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms