Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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