Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

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Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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SALL4Q9UJQ4 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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