Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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