Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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