Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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RTL8BQ17RB0 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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RTL8BQ17RB0 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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RTL8BQ17RB0 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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