Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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