Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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