Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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