Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTCH1Q13635 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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