Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NME3Q13232 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms