Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SLC14A1-214ENST00000589700 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
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MKRN3Q13064 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
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MKRN3Q13064 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
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MKRN3Q13064 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
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MKRN3Q13064 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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