Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.2 ms