Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms