Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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ZNF548Q8NEK5 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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