Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FXNQ16595 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms