Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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