Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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